В Atomic Heart две концовки. В первой Нечаев повелся на уговоры бабы Зины и ХРАЗа, ворвался к Сеченову и разнес Близняшек. Вскоре выяснилось, что ХРАЗ вел свою игру: он вырубил героев, захватил Массив и замыслил что-то недоброе. Во второй концовке Нечаев отказался идти против Сеченова.