Думаю, это потому что оно созвучно слову "прельщаться" или же вовсе от него произошло, а затем изменился его смысл.
Прельщаться , прельщение- как "прелесть" : заблуждение, искушение.
Церковь всегда проповедовала (пастве, разумеется) скромность, сдержанность, альтруизм, всепрощение, отказ от роскоши, от удовольствий- аскетизм... словом, отказ от всякой прелести.
Если ты живёшь и страдаешь - значит, это хорошо. Значит,"после смерти" ты унаследуешь разные плюшки. Но именно после смерти, а пока-никакой прелести!
Избегай соблазнов - они обман... И так далее.
Думаю, потом слово "прелесть" перестало нести изначальный , религиозный смысл и "вышло" в светскую жизнь, в светскую лексику.
Но, может, вся суть части слова "лесть".
Прелесть могло изначально быть и чем-то, что сопутствует лести : при лести.
То, что рядом с лестью.
Впоследствии "и" могла быть заменена на "е" , и осталась прелесть - тоже нечто негативное, греховное, связанное с лестью